La Congregació de les filles del Sagrat Cor de Jesús s´instal·là a Banyoles el 21 d'octubre de 1875. Durant tres anys visqueren en una casa del carrer de Sant Antoni, fins que el 12 d´abril de 1878 estrenarem el convent del carrer Nou, on encara avui dia resideixen.

Des del moment de la seva arribada, les monges obriren un centre docent dedicat a les noies en el qual impartiren l´ensenyança elemental, les classes de labor, les de dibuix i les de piano.

Amb la construcció del convent del carrer Nou s´edificaren les dependències del col·legi a la part posterior d´aquest edifici, amb l´accés des del carrer de Sant Benet.

Com la resta d´ordres religiosos, durant la Guerra, la comunitat de les monges del convent del Sagrat Cor va haver d´abandonar l´escola, la qual es convertí en escola Municipal Francesc Ferrer i Guàrdia. Les instal·lacions van ser reformades per poder assumir una capacitat de cent alumnes destribuïts en dues aules. Segons el cens escolar de l´abril de 1937 hi havia 109 alumnes inscrits en aquest centre.

Després de la guerra les monges reiniciaren la seva activitat docent per a noies, que acabà el 1986 quedant tan sols en funcionament la guarderia, que va romandre activa fins al 1995.